2021年7月22日,齐鲁工业大学生物工程学院贾保磊副教授在Cell Press旗下的国际生物技术期刊《Trends inbiotechnology》杂志发表题为“Discoveryand mining of enzymes from the human gut microbiome”的综述文章。齐鲁工业大学为该论文第一完成单位和通讯单位,贾保磊为第一作者和通讯作者。
近20年,肠道微生物组学的研究积累了大量数据,但是由于肠道中微生物的复杂性,阐明人类肠道中未知酶的功能尤其具有挑战性和难度。同时,阐明肠道微生物酶的功能可填补宏基因组学和代谢组学数据之间的知识空白,可以更好地了解肠道菌群、饮食和宿主健康之间的关系。论文从代谢物、酶催化反应、基因组序列和蛋白质结构的角度,报道了人微生物组中酶功能挖掘的策略和方法。组学数据的生物信息学分析,包括宏基因组学、代谢组学、转录组学和宏转录组学,可广泛用于酶功能的预测,不同方法的组合使用可以增加预测的准确性。这些方法将能够解释肠道中酶催化机制,并指导肠道微生物组在诊断和治疗方面的临床应用。 同时这些策略可以广泛适用于其他环境微生物组中酶功能的注释,包括并不限于动物肠道、土壤、海洋和植物微生物组。
贾保磊博士为齐鲁工业大学副教授。长期致力于肠道微生物及酶功能挖掘方面的研究,已于《gut microbes》《Plos Pathogens 》《 FASEBJ》《 JAgr Food Chem 》等期刊发表多篇研究论文。